La un moment dat, favorit clar pentru a câştiga alegerile pentru Palatul Elysee, Fillon s-a aflat în centrul unui scandal care i-a afectat campania, când un săptămânal satiric a informat că soţia sa Penelope a fost plătită cu sute de mii de euro fără a avea un post important, inclusiv câţiva ani ca asistent lacabinetul său de parlamentar.
Fillon, de 65 de ani, şi-a plătit şi doi dintre copiii săi ca avocaţi când era senator, între 2005 şi 2007.
În acel moment, Fillon a denunţat ceea ce a numit o campanie murdară şi a negat că a făcut ceva ilegal, deşi a recunoscut o eroare de apreciere.
Un analist politic desăvârşit şi fost premier în timpul preşedinţiei lui Nicolas Sarkozy, Fillon a rezistat presiunii din interiorul partidului său de a se retrage din cursa prezidenţială, dar nu a intrat în cel de-al doilea tur al alegerilor.