Faza grupelor Europa League a fost înlocuită, în premieră, cu un sistem de tipul campionat cu 36 de echipe. Fiecare echipă va întâlni opt echipe diferite şi va juca patru meciuri pe teren propriu şi alte patru în deplasare. Primele opt clasate se vor califica direct în optimile de finală. Echipele clasate pe locurile 9-24 vor participa la play-off-ul fazei eliminatorii, iar câştigătoarele meciurilor tur-retur vor ajunge şi ele în optimile de finală. Din optimi, se revine la sistemul tradiţional, în sistem eliminatoriu, tur-retur.
La tragerea la sorţi, FCSB s-a aflat în ultima urnă valorică, a patra. Din prima urnă, FCSB le va întâlni pe Glagow Rangers în deplasare şi pe Manchester United la Bucureşti.
Din urna a doua, FCSB a fost împerecheată cu două echipe greceşti. Este vorba despre PAOK Salonic, echipa lui Răzvan Lucescu pe care o va întâlni în deplasare, şi despre formaţia Olympiacos Pireu cu care va juca pe teren propriu.
Sorţii au mai stabilit ca adversari din urna a treia pentru FCSB pe FK Qarabağ (în deplasare) şi pe FC Midtjylland (pe teren propriu).
Din ultima urnă au fost desemnate ultimele două adversare ale bucureştenilor. Astfel, FCSB va juca în Germania cu TSG 1899 Hoffenheim şi cu RFS pe Arena Naţională din Bucureşti.
Etapa 1: 25-26 septembrie
Etapa 2: 3 octombrie
Etapa 3: 24 octombrie
Etapa 4: 7 noiembrie
Etapa 5: 28 noiembrie
Etapa 6: 12 decembrie
Etapa 7: 23 ianuarie
Etapa 8: 30 ianuarie
FCSB a trecut de LASK Linz în play-off-ul Europa League, scor 2-1 la general, şi s-a calificat în faza principală a competiţiei.