Cele două structuri funcţionează în prezent la Ministerul Economiei, respectiv la Ministerul Muncii.
În baza hotărârii de guvern, schema de personal a Ministerului Fondurilor Europene va creşte de la 291 la 487 posturi, prin preluarea a 78 de posturi de la Ministerul Muncii şi a 118 posturi de la Ministerul Economiei, corespunzătoare direcţiilor respective.