Surse citate de presa bulgară afirmă că investigaţia iniţiată împotriva lui Stanişev în toamna anului 2009 a atins punctul formulării acuzaţiilor. La începutul acestei luni, procurorul-şef din Sofia, Nikolai Kokinov, afirma că ancheta se apropie de final.
În octombrie 2009, actualul premier bulgar Boiko Borisov, liderul partidului GERB, afirma că Stanişev ascunsese un raport secret al Agenţiei de Stat pentru Securitatea Naţională (DANS) despre indivizii care reprezintă un risc la adresa ministerelor şi altor instituţii. Se pare că Stanişev ascunsese raportul pentru a-i proteja pe aceşti indivizi. Ulterior, Borisov a anunţat existenţa a încă opt rapoarte similare.
Potrivit surselor citate, în cazul lui Stanişev va fi impusă o cauţiune de 100.000 de leva (aproximativ 50.000 de euro).
În plus, fostul premier este anchetat pentru oferirea de protecţie grupurilor criminale, pentru spălare de bani, deturnare de fonduri şi neglijenţă în serviciu la Agenţia de Stat pentru Securitatea Naţională.
Raportul DANS i-a fost oferit lui Borisov de Aleksei Petrov, arestat în februarie în cadrul operaţiunii Caracatiţa.