Eduard Baghirov a fost deţinut la 16 iunie sub suspiciunea de organizare a unor revolte în R.Moldova la 7 aprilie 2009, când o mulţime de protestatari a forţat intrarea în clădirea Parlamentului şi administraţiei prezidenţiale. Tribunalul a decis menţinerea în detenţie a lui Baghirov până la proces.
Camera Publică a declarat într-o scrisoare că jurnalistul este „deţinut într-o instituţie de detenţie din Chişinău în condiţii care nu îndeplinesc standardele internaţionale”.
„El este subiectul unor ameninţări şi presiuni. Noi considerăm un astfel de tratament inacceptabil”, se arată în scrisoare.
Camera cere Ministerului de Externe să „ia toate măsurile posibile pentru a apăra interesele ruse în străinătate”.
În aprilie 2009, protestele conduse de opoziţie după alegerile parlamentare din R.Moldova au degenerat în violenţe.