Născut la 23 martie 1923 la Atena, Ioannidis a fost unul dintre instigatorii loviturii de stat din 21 aprilie 1967, condusă de triumviratul Georges Papadopoulos, Stylianos Pattakos şi Nicolaos Makarezos, care a impus o dictatură până în vara lui 1974.
Angajat împotriva trupelor comuniste în timpul războiului civil (1946-1949), el a condus ulterior lagărul din insula Makronissos, situată la est de Atena, înainte de a servi în Cipru.
După puciul militar, el a fost liderul poliţiei militare greceşti (ESA), celebră pentru execuţiile şi torturile sale. El a fost numit colonel în 1970 şi general de brigadă în 1973.
La ordinele sale, armata a asediat şcoala politehnică la 17 noiembrie 1973, înecând în sânge o revoltă studenţească ce ameninţa regimul. El va prelua la 25 noiembrie puterea, înlăturând de la putere triumviratul condus de Papadopoulos.
Dictatura sa s-a prăbuşit în vara lui 1974, odată cu intervenţia trupelor turce în Cipru, ca răspuns la o lovitură de stat împotriva arhiepiscopului Makarios, organizată de Ioannidis.
La reinstalarea democraţiei, membrii juntei au fost condamnaţi la moarte pentru „înaltă trădare”. Ei au fost graţiaţi de Constantin Caramanlis, care a condus ţara către democraţie şi care le-a comutat pedeapsa în închisoare pe viaţă.
Ioannidis, care a refuzat să ceară graţierea preşedintelui, era ultimul membru al juntei aflat în detenţie. Makarezos şi Pattakos au fost eliberaţi condiţionat în anii ’90 din motive de sănătate.
Papadopoulos a decedat în urmă cu 11 ani, iar Makarezos anul trecut. Stylianos Pattakos, în vârstă de 97 de ani, locuieşte într-o staţiune balneară din apropiere de Atena.