Steaua a fost prima echipă din România care s-a calificat în grupele Cupei UEFA, în sezonul 2004-2005, după ce a eliminat, în primul tur, formaţia ŢSKA Sofia: 2-1 la Bucureşti şi 2-2 la Sofia. La prima ediţie în care Cupa UEFA s-a desfăşurat în sistem grupe, după primul tur, Steaua a fost repartizată în grupa B, alături de Standard Liege, Athletico Bilbao şi Parma. Echipa antrenată la acea vreme de Walter Zenga a ocupat locul trei în grupă şi s-a calificat în sferturile de finală, unde a învins deţionătoarea trofeului, Valencia, 4-3, după executarea loviturilor de departajare, dar a fost eliminată în optimi, de Villarreal, 0-0 la Bucureşti şi 0-2 în Spania.
În sezonul următor, 2005-2006, Steaua, Rapid şi Dinamo s-au calificat în grupe, de unde doar Steaua şi Rapid au izbutit să treacă de faza grupelor. De altfel, cele două formaţii s-au întâlnit în sferturile de finală ale Cupei UEFA, unde echipa din Bulevardul Ghencea, antrenată de Cosmin Olăroiu, a avut câştig de cauză, după 1-1 în Giuleşti şi 0-0 pe stadionul Naţional din complexul Lia Manoliu. Steaua a fost la un pas de calificarea în finala competiţiei, dar a fost eliminată în semifinale, de Middlesborough 1-0, la Bucureşti şi 2-4, în Anglia.
Dinamo şi Rapid au fost echipele care au reprezentat România în ediţia 2006-2007, însă doar gruparea din Şoseaua Ştefan cel Mare a obţinut calificarea în şaisprezecimile de finală, unde a fost eliminată de Benfica Lisabona. În aceeaşi fază a competiţiei, Steaua, care s-a calificat după ce a obţinut locul trei în grupele Ligii Campionilor, a fost eliminată de FC Sevilla.
În sezonul trecut, România a avut trei formaţii la startul Cupei UEFA. CFR Cluj a fost eliminată în turul doi preliminar de Anorthosis Famagusta, 1-3 în tur şi 0-0 în manşa a doua, la Nicosia, în timp ce Rapid şi Dinamo au ieşit din competiţie în turul I. Rapid a fost eliminată de FC Nurnberg, 0-0 şi 2-2, iar Dinamo de IF Elfsborg, după 1-2 la Bucureşti şi 1-0 la Elfsborg.
România a fost reprezentată de cinci echipe în ediţia actuală a Cupei UEFA: FC Vaslui, Unirea Urziceni, FC Timişoara, Rapid şi Dinamo.
Toate cele cinci formaţii au părăsit competiţia: Rapid Bucureşti a ratat calificarea în grupele Cupei UEFA, după ce a fost eliminatã de VfL Wolfsburg, 0-1 şi 1-1; Unirea Urziceni a pierdut în faţa formaţiei SV Hamburg 0-0 şi 0-2; FC Vaslui a părăsit competiţia neînvinsă, după 0-0 şi 1-1. Echipa FC Timişoara este singura formaţie care nu a reuşit să aducă niciun punct în clasamentul coeficienţilor UEFA, fiind eliminată de Partizan Belgrad 1-2, la Timişoara, şi 0-1 la Belgrad. Dinamo nu a putut trece de olandezii de la NEC Nijmegen, 0-1 şi 0-0.